Program studi magister Pendidikan Fisika diselenggarakan berdasarkan SK MENRISTEK DIKTI RI No. 15/ KPT/ 2015 sebagai bagian dari Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan yang sementara ini menginduk di Pascasarjana UNS. Program studi magister Pendidikan Fisika memiliki bebrapa keunggulan diantaranya:
- Melakukan kuliah pakar setiap tahun sekali dengan mengundang pembicara dari dalam dan luar negeri
- Seminar nasional/ internasional
- Dosen yang memiliki kepakaran dalam bidangnya masing-masing
- Perpustakaan yang memadai
- Laboratorium Fisika
- Melakukan kerjasama dengan lembaga/ universitas dalam dan luar negeri