Program Studi Ilmu Teknologi Pangan (ITP) FP UNS banyak menjalin kerjasama dengan sesama perguruan tinggi dalam dan luar negeri, LIPI, BPPT, Industri pangan (perusahaan makanan dan minuman), Badan POM, Balitbang Kementerian Kelautan dan Perikanan, Balitbang Kementerian Pertanian, Pemerintah Daerah/Pemerintah Kota, Badan Ketahanan Pangan, GAPMMI, UKM/UMKM, lembaga non pemerintah dan yang lainnya.

Beberapa perguruan tinggi luar negeri yang menjalin kerjasama dengan Program Studi Ilmu Teknologi Pangan (ITP) FP UNS dalam bingkai aktivitas kolaboratif pada bidang akademik (exchange programs) dan riset, antara lain: Ghent University (Belgia), Suranaree University of Technology (Thailand), Universiti Putra Malaysia (Malaysia), Hiroshima University (Jepang), Osaka University (Jepang), Gifu University (Jepang), University of South Australia (Australia), Universiti Malaysia Sabah (Malaysia), Kasetsart University (Thailand), North Dakota State University (USA).