Kerjasama dijalin oleh Program Studi S1 Farmasi FMIPA UNS dengan berbagai instansi pemerintah maupun swasta meliputi rumah sakit, apotik, Industri, Dinas Kesehatan, lembaga penelitian (B2P2TOOT, BATAN, dll), Perguruan Tinggi maupun lembaga lainnya, baik tingkat nasional maupun internasional. Lingkup kerjasama meliputi kegiatan magang mahasiswa,kolaborasi riset, kuliah kepakaran, dan tugas belajar.

Contoh kegiatan tersebut adalah penandatangan MOU Program Studi S1 Farmasi FMIPA UNS dengan Kulliyyat of Pharmacy IIUM Malaysia pada 19 Desember 2017, dimana salah satu implementasi MOU tersebut kegiatan student internship di fasilitas IKOP IIUM.